Il a fait ces commentaires en s'adressant à des milliers de manifestants lors d'un rassemblement pro-palestinien à Istanbul.
Le ministre israélien des Affaires étrangères, Eli Cohen, a réagi en ordonnant le retour des diplomates.
Le Premier ministre Benjamin Netanyahu a insisté qu'Israël avait "l'armée la plus morale du monde".
Israël a intensifié ses frappes sur la bande de Gaza, trois semaines après que le Hamas a lancé son attaque sur le sud d'Israël, faisant plus de 1 400 morts et prenant 229 personnes en otage.
S'adressant à une foule de plusieurs centaines de milliers de sympathisants palestiniens samedi, le président turc a clamé que "le principal responsable du massacre qui se déroule à Gaza est l'Occident".
"Israël commet ouvertement des crimes de guerre depuis 22 jours, mais les dirigeants occidentaux ne peuvent même pas appeler Israël à un cessez-le-feu, et encore moins y réagir", a-t-il déclaré.
Il a accusé Israël de se comporter comme un "criminel de guerre" et d'essayer d'"éradiquer" les Palestiniens.
Il a poursuivi en ces termes : "Bien sûr, chaque pays a le droit de se défendre. Mais où est la justice dans cette affaire ? Il n'y a pas de justice - juste un massacre vicieux à Gaza".
Cette déclaration fait suite à des messages postés par le dirigeant turc plus tôt dans la journée de samedi sur X, anciennement connu sous le nom de Twitter, dans lesquels il déclarait que la dernière escalade avait visé des "civils innocents" et aggravé la crise humanitaire à Gaza, ajoutant : "Israël doit immédiatement cesser cette folie et mettre fin à ses attaques".
Quelques instants après que le président Erdogan a terminé son discours lors du rassemblement, le ministre israélien des Affaires étrangères, M. Cohen, a écrit sur X : "Compte tenu des graves déclarations venant de Turquie, j'ai ordonné le retour des représentants diplomatiques sur place afin de procéder à une réévaluation des relations entre Israël et la Turquie".
Le Premier ministre israélien, M. Netanyahou, a martelé plus tard : "Ne nous accusez pas de crimes de guerre. Si vous pensez que vous pouvez accuser nos soldats de crimes de guerre, c'est de l'hypocrisie. Nous sommes l'armée la plus morale du monde".
Il a ajouté que les forces de défense israéliennes prenaient des précautions pour protéger les civils et a accusé le Hamas de commettre des crimes contre l'humanité en "utilisant son peuple comme bouclier humain".
Les deux pays entretiennent depuis longtemps des relations tendues.
Autrefois proches alliés, la Turquie a rompu ses relations diplomatiques avec Israël en 2010 après que dix militants turcs pro-palestiniens ont été tués lors d'affrontements avec des commandos israéliens qui avaient abordé un navire appartenant à la Turquie et tentant de briser le blocus maritime israélien de la bande de Gaza.
Les relations ont été rétablies en 2016, mais les deux pays ont expulsé leurs plus hauts diplomates respectifs en 2018 dans le cadre d'un différend sur le meurtre de Palestiniens par Israël lors de manifestations à la frontière entre Gaza et Israël.
La Turquie ne considère pas le Hamas comme une organisation terroriste, contrairement à des pays comme les États-Unis et le Royaume-Uni. Elle accueille depuis longtemps ses membres et soutient une solution à deux États.
