M. Fergus, premier homme noir à occuper ce poste, a été choisi par les 338 membres de la Chambre à l'issue d'un vote à bulletin secret mardi.
Il a déclaré que c'était "un grand honneur" d'avoir été choisi pour cette fonction.
L'ancien président a démissionné après avoir invité au Parlement un Ukrainien qui a combattu pour une unité nazie.
Anthony Rota a affirmé qu'il n'était pas au courant des liens nazis de l'ancien combattant.
Sept candidats étaient en lice pour le remplacer mardi.
Dans ses premières remarques, M. Fergus a exhorté ses collègues à se traiter mutuellement avec respect au sein de l'Assemblée, un lieu qu'il a qualifié de "débat passionné".
"Nous leur montrerons que la politique est une profession noble", a-t-il promis.
Outre son rôle de député, M. Fergus, 54 ans, a été secrétaire parlementaire du président du Conseil du Trésor et du ministre de la santé.
M. Fergus a été élu pour la première fois en 2015 en tant que député de la circonscription québécoise de Hull-Aylmer, près d'Ottawa, l'année où le parti du Premier ministre Justin Trudeau a pris le pouvoir.
